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Oligo의 보관법 및 사용방법 |
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| *Oligonuceotide는 일반적으로 동결건조된 pellet상태로 공급됩니다.
이것은 운송시, 온도 등 여러가지조건에 의해 일어날수 있는 합성된 DNA들의 분해를 방지하기 위함입니다.
Dry된 올리고는 때때로 운송과정 및 기타사유로 tube이 뚜껑을 여는순간 pellet이 쉽게 손실될수 있습니다.
특히 Latex장갑등을 끼고 뚜껑을 개봉하면 마찰에 의해 oligo를 손실할 경우가 발생합니다.
따라서 tube을 열기전에 먼저 잠깐 centrifuge에 돌리시고 tube를 개봉하면 됩니다.
*일반적으로 oligo는 -20℃에세 1년정도 안정하다고 볼수 있습니다.
Oligo제품을 수령후 멸균증류수로 잘 녹인후 여러 tube에 보관하시는것이 안전합니다.
냉동과 해동을 반복할시 oligo의 이상이 발생될 소지가 있습니다.
용액상태로 보관시에는 멸균증류수보다 TE(10mM Tri-HCl(Ph8.0), 1mM EDTA)buffer에 녹이는것이 오래 보관할 수 있습니다.
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| ◈ 동일한 Oligo합성시 서로 다른 OD값 |
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OLIGO합성에 사용되는 Column내 CPG(controlled pore glass)의 양에
따라 합성되는 oligo의
yiled는 달라집니다.
예를 들면 소비자가 50nmol scale로 주문할경우 합성기의 column안에는
최소한 합성을 위한
3’base의 양이 50nmol 이상이 양을 넣고 합성을 시작합니다.
50nmol scale이란 합성시 starting yield이며 최종 양의 final yield를 의미하는것은 아닙니다.
* oligo 합성수율을 결정짓는 요인:
oligo size, coupling effcency, base
Composition, 정제방법등 입니다.
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| ◈ TM(melting temperature)값 |
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Oligonucleotide의 50%는 duplex형태, 50%는 single-strand형태를
지닐때의 온도를 말하며,
oligonudleotide의 sequence, oligonucleotide의농도,그리고
PCR반응시의 salt농도 등에 의해
영향을 받습니다.
* TM값은 절대적인 값은 아닙니다.
실험자가 Template를 준비하는 과정에서 생길수있는 여러가지 불순물과 salt들에 의해 여러가지
변수가 생길수 있습니다.
따라서 당사 TM값을 참고로 실험을 하시고 만약 실험결과가 나오지 않을경우 해당 TM값보다 4-
5도 낮은조건으로 실험을 하시면 좋습니다.
* 만일 기준TM값에서 Non-specific product가 많은 경우에 annealing
temperature를 높여가면
서 실험조건을 찾아야 합니다.
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| ◈ 합성 Oligo가격 |
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| 합성scale |
0.05umol |
0.05umol |
0.05umol |
0.2umol |
1.0umol |
| 합성염기수 |
~30mer |
~40mer |
~50mer |
~99mer |
~120mer |
| 가격/base |
\
650 |
\
650 |
\
750 |
\
1000 |
\
2,500 |
| OPC정제 |
무료 |
무료 |
무료 |
무료 |
무료 |
| PAGE정제 |
\25,000 |
\25,000 |
\25,000 |
\25,000 |
\35,000 |
| HPLC정제 |
\30,000 |
\30,000 |
\30,000 |
\30,000 |
\50,000 |
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*1회
1,000mer이상 주문시 550/mer 입니다.
*1회 200,000원 이상 주문시 문화상품권 1매 발송
*NO Setup charge(단 주문수량이 3column 이하는
택배요금
4,000원 부가)
**** 50mer 이상의 oligo합성의 경우 PAGE/HPLC정제를
권해드립니다. ****
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| ◈ Modification Oligo List |
| 5’
Fluorescein |
3’
Fluorescein |
5’
Biotin |
3’
Biotin |
| 5’
Phosphate |
3’
Phosphate |
5’
Amine(C6) |
3’
Amine(C6) |
| 5’
TAMRA |
3’
TAMRA |
5’
Thiol(C6) |
3’
Thiol(C3) |
| 5’
Rhodamine |
3’
Rhodamine |
5’
Dig |
3’
Dig |
| 5’
FAM |
5’
HEX |
5’
TET |
5’
Texas Red |
2’-
O - Methyl
|
Taqman
Probe |
Phosphorothioate |
RNA |
| Inosine(dl) |
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대량합성 및 기타 Modification oligo 는 문의바랍니다.
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